第五届理事会期间，2005年5月，经国家卫生部批准，协会承担了“全国百万妇女乳腺普查工程”，召开了工程授牌启动大会，制定了乳腺癌普查实施方案、技术规范和质量标准，在全国20个省市40个普查定点医院开展了试点工作，完成3万多适龄妇女(35-70岁)的普查任务，早期发现率达到34%。

自第六届理事会起，协会开始承接政府职能转移。2008—2009年，协会受卫生部委托，启动了“中央财政转移支付地方乳腺癌检查项目”，中央财政每年转移支付1938万元，在全国30个省市自治区设立53个筛查点，共筛查91万人，确诊乳腺癌466人。2010—2011年，继续实施“全国农村妇女乳腺癌筛查项目”(国家重大公共卫生服务项目)，在全国设立200个项目点，筛查妇女146万人，确诊病例636人。协会作为项目的技术支持单位，制定技术方案，举办技术培训，开展现场督导，进行数据录入，并以早诊率、生存率和死亡率的变化为观察指标进行绩效评价以及独立的卫生经济学评价，为项目的实施做出了重要贡献。卫生部部长陈竺院士专门来信致谢。

2013年，为了充分利用“中国妇女乳腺癌筛查项目”的筛查成果，探索出一条适合中国国情和中国妇女生物学特性的乳腺癌筛查模式，协会开展了“中国女性乳腺癌优化筛查方案的多中心队列研究”，成立了以郝希山院士为首的专题组，对2008—2011年在北京、天津、沈阳、南昌、山东肥城曾参加过筛查的35000名筛查对象，采用当年相同的方法，再次进行了临床乳腺检查、超声检查和钼靶X线摄影检查。乳癌筛查项目复查一方面早诊早治，给当地妇女群众带来了福音;一方面综合两次数据，比较三种方法的筛查效果，评价各筛查方法的准确性和效果成本比，从提高准确率、降低筛查成本、为民谋利诸方面，确立了一套适合我国国情的乳腺癌筛查方案，对各地开展的乳腺癌筛查起到了指导作用，促进了协会进一步为社会服务。

2013-2015年，协会开展了“中国抗癌协会贫困地区癌症救助试点项目”。这是民政部中央财政支持社会组织参与社会服务项目之一。三年来，协会组织由理事长郝希山院士、副理事长詹启敏院士带领的团队，赴江西赣州、瑞金、靖安、遂川、南昌以及贵州毕节大方县等地区，依托地方医疗机构，对适龄妇女进行乳腺癌和宫颈癌的免费筛查，共完成两癌筛查12000例。其中，对筛查的可疑阳性者免费进行钼靶影像检查或阴道镜及病理检查;对部分疑难病例，由知名专家会诊确诊;对确诊患者，指导规范化治疗或实施手术治疗，并对贫困癌症患者发放治疗救助金。项目累计资助70余位贫困患者，发放救助金40余万元。此外，通过医师讲座、病例会诊、带教查房，典型案例解读等开展当地医师诊疗培训，累计培训1400余名基层医务工作者，并由协会负责，帮助瑞金市妇幼保健院和大方县人民医院建设肿瘤专科，资助当地30余位骨干专业技术人员赴国家级专科医院进修培训，涉及肿瘤内科、外科、病理、影像、B超等多学科，进修培训时间6个月到一年不等。

该项目配合了“罗霄山区连片特困地区区域发展与扶贫攻坚规划”，收到了来自瑞金、兴国等地方机构感谢信，CCTV等70多家媒体做了报道。2013年，中国科协冯长根副主席、党组成员沈爱民等领导亲赴贵州考察此项目给予肯定。2014年，在民政部项目总结会议上，协会进行了经验介绍。