大会于 2000 年 10 月在北京举行，由中国抗癌协会与中华医学会联合主办，国内 30 个省市 2200 名代表参会，国外代表 40 人出席。会议收到论文 2000 余篇，获得中国科协重点学术项目 A 级奖励。2002 年 9 月在杭州举办了第二届中国肿瘤学术大会，10 多位院士、40 多位国外专家、200 多名国内专家共 2500 余名代表出席会议。大会设置了 25 个分会场，收到论文 2792 篇，交流论文 700 余篇，壁报交流 500 余篇。从此中国肿瘤学术大会每两年一届，成为我国肿瘤界最具影响力的学术盛会。

大会于 1999 年 1 月 8 日 -12 日在哈尔滨召开，出席会议代表 500 多名，其中台湾代表 80 名。会议收到论文 600 余篇，其中台湾提交论文 48 篇。第二届海峡两岸肿瘤学术会议于 2002 年 9 月在杭州举行，与上述第二届全国肿瘤学术大会一并召开。此期间，协会还联合中华医学会承办了第七届亚洲结直肠癌学术大会（1999 年）、第一届国际华人肿瘤学术会议（2000 年）。

1998 年协会被卫生部确认为国家级继续教育项目申报单位，自 1999 年起至 2002 年，先后举办 34 个国家级继续教育培训班， 1600 多人参加学习和培训；同时组织专家修订再版《新编常见恶性肿瘤诊治规范》，共 12 个分册，在全国发行。

1989 年 12 月 20 日 -24 日，由中国科协主办、中国抗癌协会、中华医学会等十个涉医学会共同承办的“全国肿瘤防治学术研讨会”在北京举行。会议提出了《关于加强肿瘤防治研究工作的建议》，引起有关部门的重视，作为国家制定防治计划的依据之一。各专业委员会、省市自治区抗癌协会积极建议献策。抗癌药物专业委员会在广西南宁召开第三届全国肿瘤药物和化疗学术会议，通过了《抗癌药物筛选规程、临床前疗效和毒性研究规程》，被国家卫生部药审办批准实施。

1998 年 11 月 28 日，协会与太极集团有限公司签订协议，建立中国抗癌协会太极抗癌科学基金。第二年在基金资助下，组织中国医科院肿瘤医院、北京大学肿瘤医院、天津医科大学肿瘤医院、上海复旦大学肿瘤医院、广东中山大学肿瘤医院，为全国各省市 80 名医师提供为期一年的专业进修，培养了一批高素质的肿瘤专业骨干。在基金支持下，还开展了肿瘤临床流行病学调查，收集了全国十大肿瘤近五年生存率统计资料。 第四届理事会期间，批准成立了肿瘤转移、肿瘤信息、临床肿瘤协作三个专业委员会；内蒙古自治区和新疆维吾尔自治区先后成立了抗癌协会；协会已有专业委员会 27个、省市自治区抗癌协会 28个，会员 28865人。协会增加了对全国性学术会议的补助，由 5000 元提高到10000 元，进一步推动了学术活动的开展。1998-2002 年，各专业委员会举办全国和国际性会议 60 多个，参会 15000 余人次，交流论文 10600余篇。学术期刊增加了《中国肺癌杂志》（与中国防痨协会联办），协会主办期刊年发行 17000 册，入编论文约 1500 篇。科普宣传呈现新的局面，“4.15 全国肿瘤防治宣传周”参加单位大幅度增加，成为标志性的活动。协会组织百余名肿瘤专家编写出版了《肿瘤防治科普丛书》，百余万字，共 13 分册。癌症康复组织已发展到 75 个，会员 6 万余人，相继组织了全国万名癌症患者签名支持北京申奥、抗癌勇士迎接新世纪第一缕曙光（百名癌症康复者赴浙江温岭看我国第一日出）等富有影响的活动。第四届理事会期间，先后在天津、浙江温州、成都召开了两次理事会和三次常务理事会。其中 1998 年4 月在温州召开的四届二次理事会，通过了《中国抗癌协会专业委员会组织条例》，并分别召开了“专业委员会工作会议”和“地方抗癌协会工作会议”。不久，根据国家民政部和中国科协的要求，协会将中国抗癌协会地方分会改为各省市自治区抗癌协会，由省市自治区科协领导，中国抗癌协会业务上指导。 第四届理事会期间，批准成立了肿瘤转移、肿瘤信息、临床肿瘤协作三个专业委员会；内蒙古自治区和新疆维吾尔自治区先后成立了抗癌协会；协会已有专业委员会 27个、省市自治区抗癌协会 28个，会员 28865人。协会增加了对全国性学术会议的补助，由 5000 元提高到 10000 元，进一步推动了学术活动的开展。1998-2002 年，各专业委员会举办全国和国际性会议 60 多个，参会 15000 余人次，交流论文 10600 余篇。学术期刊增加了《中国肺癌杂志》（与中国防痨协会联办），协会主办期刊年发行 17000 册，入编论文约 1500 篇。科普宣传呈现新的局面，“4.15 全国肿瘤防治宣传周”参加单位大幅度增加，成为标志性的活动。协会组织百余名肿瘤专家编写出版了《肿瘤防治科普丛书》，百余万字，共 13 分册。癌症康复组织已发展到 75 个，会员 6 万余人，相继组织了全国万名癌症患者签名支持北京申奥、抗癌勇士迎接新世纪第一缕曙光（百名癌症康复者赴浙江温岭看我国第一日出）等富有影响的活动。第四届理事会期间，先后在天津、浙江温州、成都召开了两次理事会和三次常务理事会。其中 1998 年4 月在温州召开的四届二次理事会，通过了《中国抗癌协会专业委员会组织条例》，并分别召开了“专业委员会工作会议”和“地方抗癌协会工作会议”。不久，根据国家民政部和中国科协的要求，协会将中国抗癌协会地方分会改为各省市自治区抗癌协会，由省市自治区科协领导，中国抗癌协会业务上指导。