2004 年 9 月，第三届中国肿瘤学术大会在广州举行，参会代表 4000 余名。大会邀请了诺贝尔医学奖获得者和美国临床肿瘤学会专家做报告，设立 15 个分会场供 30个肿瘤专业学科交流。2006年 10月 26日 -29日，第四届中国肿瘤学术大会在天津举行，2948 名代表出席会议，其中国外代表 88 人。会上 16 名院士和国内外著名专家作专题报告。国际抗癌联盟、中国抗癌协会和中华医学会肿瘤分会共同签署，向世界发出了“你我手拉手，共同抗击癌症”的天津宣言。

前四届海峡两岸肿瘤学术会议时间地点没有固定，第一、二届会议间隔了三年，有三届会议都在大陆举行。自第五届会议开始，海峡两岸肿瘤学术会议每年一次，分别在大陆和台湾间隔举行。协会偶数年主办，与中国肿瘤学术大会联合召开。2006 年 10 月，协会举办第四届中国肿瘤学术大会，同期举办了第五届海峡两岸肿瘤学术会议。

世界抗癌大会是世界肿瘤界最有影响力的学术盛会。2006 年，协会组团参加了在美国亚特兰大召开的第 19 届世界抗癌大会，申办第 21 届世界抗癌大会一举成功，郝希山常务副理事长当选为国际抗癌联盟常务理事。

2006 年 11 月，国家科技部批准设立中国抗癌协会科技奖，授予用先进科学技术成果、在肿瘤防治医学等方面做出突出贡献的医学科技工作者和单位。这是我国肿瘤医学领域唯一的社会力量设奖。

2005 年 10 月，在济南召开全国肿瘤期刊和信息工作会议，决定共同创建系列杂志。2006 年 9 月，在天津召开中国抗癌协会系列杂志编辑部主任会议，研究修订了《中国抗癌协会系列杂志管理办法》，制定了实施方案，共有 29 种肿瘤期刊参加协作，占全国肿瘤期刊64%。从 2007 年开始，系列期刊采用统一标志。

2007 年，协会网站在北京运行，成为重要的宣传服务窗口。 五届理事会期间，成立了神经肿瘤、肿瘤影像、肿瘤介入、肿瘤微创、肿瘤心理学、胰腺癌 6 个专业委员会。青海、甘肃先后成立抗癌协会。截止到 2007 年10 月，协会已有 33 个专业委员会、30 个省市自治区抗癌协会、46 个团体会员单位，个人会员 35000 多名。其中专业会员 6000 余名。2003—2007 年，举办全国性肿瘤学术会议 95 次、国际学术会议 9 次，参会 33724人次。其中国外代表 1690 人，交流论文 20946 篇。“4.15全国肿瘤防治宣传周”遍及全国，五年来印发科普宣传品（书籍、挂图、光盘、册子、单页）50 余万册，举办科普报告、科普讲座、科普展览 2250 次，参与 125万人次。《癌症康复》《防癌报》《抗癌》等科普报刊和“全国癌症康复者文艺汇演”等产生了广泛的影响。 2005 年 5 月，经卫生部批准，协会承办“全国百万妇女乳腺普查工程”，召开了工程授牌启动大会，制定了乳腺癌普查实施方案、技术规范和质量标准，在全国 20 个省市 40 个普查定点医院开展了试点工作，完成 3 万多适龄妇女（35-70 岁）的普查任务，早期发现率达到 34%。后因政府的普查经费和相关政策支持滞后而中断。